Toto je seznam destinací letecké společnosti Croatia Airlines. Níže jsou uvedena letiště seřazená dle kontinentů, oblastí, států a měst.

Asie

Izrael

• Tel Aviv – Mezinárodní letiště Ben Gurion (sezónně)

Evropa

Rakousko

• Vídeň – Mezinárodní letiště Vídeň

Belgie

• Brusel – Letiště Brusel

Bosna a Hercegovina

• Sarajevo – Mezinárodní letiště Sarajevo

Chorvatsko

• Bol – Letiště Bol (sezónně)
• Osijek – Letiště Osijek (sezónně)
• Dubrovník – Letiště Dubrovník
• Pula – Letiště Pula
• Split – Letiště Split
• Zadar – Letiště Zadar
• Záhřeb – Letiště Záhřeb

Dánsko

• Kodaň – Letiště Kodaň

Francie

• Paříž – Letiště Charlese de Gaullea
• Lyon – Letiště Saint-Exupéry (sezónně)

Německo

• Düsseldorf – Letiště Düsseldorf (sezónně)
• Frankfurt – Letiště Frankfurt
• Mnichov – Letiště Franze Josefa Straußa

Řecko

• Atény – Mezinárodní letiště Eleftherios Venizelos (sezónně)

Itálie

• Řím – Letiště Leonarda da Vinci
• Venice – Letiště Marco Polo (sezónně)

Kosovo

• Priština – Mezinárodní letiště Priština

Makedonie

• Skopje – Letiště Skopje

Černá Hora

• Podgorica – Letiště Podgorica

Nizozemsko

• Amsterdam – Letiště Schiphol

Srbsko

• Bělehrad – Letiště Bělehrad

Španělsko

• Barcelona – Letiště Barcelona (sezónně)

Švýcarsko

• Curych – Letiště Curych

Turecko

• Istanbul – Mezinárodní letiště Atatürk